Pour aborder de façon aussi complète que possible l'étude la zone côtière, le Programme National en Environnement Côtier  (PNEC) structure les travaux de recherche visant à approfondir les connaissances fondamentales nécessaires pour répondre à la demande socio-économique. Ces travaux sont conduits sous la forme de chantiers géographiques ou d'actions de recherche thématiques.

Le chantier "Lagunes Méditerranéennes" auquel collabore le Laboratoire Environnement littoral de Sète concerne particulièrement l'étang de Thau, dont les élevages d'huîtres et de moules représentent 10% de la production conchylicole nationale. La démarche consiste à décrire, avec des modèles mathématiques les différents processus physiques et biologiques contrôlant la productivité et l'état sanitaire de ces écosystèmes. Il s'agit d'améliorer la compréhension du fonctionnement de l'écosystème et de développer les outils nécessaires au diagnostic des phénomènes environnementaux majeurs ou des effets d'aménagements.Les partenaires du PNEC

Ifremer : Institut français de Recherches pour l'Exploitation de la Mer

CNRS : Centre National de la Recherche scientifique

INSU : Institut National des Sciences de l'Univers

IRD : Institut de Recherche pour le Développement

BRGM : Bureau de Recherches Géologiques et Minières

CEMAGREF : Institut de Recherche pour l'Ingéniérie de L'Agriculture et de l'Environnement

Total-Fina-Elf

CNES : Centre national d'Etudes Spatiales